清源縣，中國古代的縣。
武則天聖歷二年（699年）置清源縣，屬武榮州。清源縣治所清源城（即今福建省仙遊縣西北大濟鎮）。次年改屬泉州（治所在閩縣，今福州市），後又改屬武榮州。唐睿宗景雲二年（711年）武榮州改為泉州（治所在南安縣）。唐玄宗天寶元年（742年）清源縣改名仙遊縣，並移治今仙遊縣城鯉城街道。
