本草經集注》是南北朝道士陶弘景在有系統整理《神農本草經》並總結之前藥學經驗基礎上編寫的一部醫書。本書結合《神農本草經》和《名醫別錄》兩書並注釋而成。

《本草經集注》在《神農本草經》365種藥物的基礎上增加至730種藥物,並且首創按照藥物性質分類的方法,為以後的本草書籍所繼承。