陳冲內閣（2012年2月6日－2013年2月18日） |
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| 行政院院長 | |
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| 行政院副院長 | |
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| 行政院秘書長 | 林益世（2012年2月6日－2012年6月29日） → 陳士魁（2012年6月29日－2013年2月17日） |
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| 部、會 |
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| | 楊進添（2009年9月10日－2012年9月25日） → 林永樂（2012年9月26日－ ） |
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| | 劉憶如（2012年2月6日－2012年5月30日） → 張盛和（2012年6月1日－ ） |
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| | 施顏祥（2009年9月10日－2013年2月17日） |
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| | 毛治國（2008年5月20日－2013年2月17日） |
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| 署、附屬二級機關 |
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| 行政院衛生署署長 | |
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| | 尹啟銘（2012年2月6日－2013年2月17日，政務委員兼任） |
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| | 賴幸媛（2008年5月20日–2012年9月28日） → 王郁琦（2012年9月28日－ ） |
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| | 朱景鵬（2009年9月30日－2012年7月10日） → 宋餘俠﹝2012年7月10日－ ） |
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| | 王如玄（2008年5月20日－2012年9月30日） → 潘世偉（2012年10月1日－ ） |
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| | 吳泰成（2012年2月6日－2012年3月25日） → 黃富源（2012年3月26日－ ） |
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| | 胡幼偉（2012年5月20日－2012年10月7日） → 黃敏恭(代理)（2012年10月7日－2012年10月22日） → 鄭麗文（2012年10月23日－ ） |
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| 獨立機關與其他內閣機關 |
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| | 吳秀明（2010年2月1日－ ；任期制的獨立機關，不受內閣改組影響） |
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| | 張博雅（2010年11月12日－ ；任期制的獨立機關，不受內閣改組影響） |
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| | 蘇蘅（2010年8月11日－2012年7月31日） → 石世豪（2012年8月1日－ ；任期制的獨立機關，不受內閣改組影響） |
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| | 彭淮南（1998年2月25日－ ；任期制部會機關，不受內閣改組影響） |
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| | 周功鑫（2008年5月20日－2012年7月29日） → 周筑昆(2012年7月30日－2012年9月18日) → 馮明珠（2012年9月14日－﹞ |
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| 不管部會之政務委員 |
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| 薛承泰（2009年2月16日－2013年2月16日） | | 尹啟銘（2012年5月20日－2013年2月17日）（再任） | | | | | | | | | | | | | | |
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