真菌(英語:Fungi)是一大群真核生物中的任何成員,包括了微生物霉菌酵母,也包括最常見的蘑菇。真菌是與动物植物並列的一個。致力於真菌研究的生物學科被稱為真菌學,它往往被視為植物學的一個分支,儘管遺傳研究表明,相比於植物,真菌和動物的關係更為密切。真菌的繁殖是通过孢子,这往往产生特殊结构或子实体,如蘑菇头。在世界范围内丰富,大多数真菌对于肉眼并不引人注意,这是因为它们结构的小尺寸,以及它们在土壤中和在死的物质中的隐蔽生活方式,并作为植物,动物,或其它真菌的共生体。真菌界包含 壺菌門接合菌門聚合菌門以及雙核亞界中的子囊菌門擔子菌門

真菌的分類,在學界裡,高階分類首先以有性生殖的方式作為分類依據,將真菌界分為接合菌、子囊菌和擔子菌三個門。接合菌的有性生殖產生接合孢子,例如黑黴菌;子囊菌的有性生殖產生子囊孢子,有些子囊菌的產孢構造簡單,只有單細胞形成子囊,例如酵母菌;有些子囊菌則形成大型子實體,在子實體上產生大量的子囊和子囊孢子,例如羊肚菌;擔子菌的有性生殖產生擔孢子黑穗菌的擔子由單細胞的冬孢子產生,但大多數的擔子菌都產生大型子實體,一般稱為蕈,例如香菇洋菇等食用菇類及毒蕈。
儘管它們有對人類事務的重要性,很少有人知道真菌界真正的生物多樣性,其中估計為大約150萬個品種,其中約5%已被正式分類。
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