细柱藻科（学名：Leptocylindraceae）为细柱藻目的一个科。
细柱藻科
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科学分类 
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| 界：
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色藻界 Chromista
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| 门：
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淡色藻门 Ochrophyta
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| 纲：
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硅藻纲 Bacillariophyceae
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| 目：
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细柱藻目 Leptocylindrales
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| 科：
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细柱藻科 Leptocylindraceae
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| 属
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见正文
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本科包括以下属：
- 细柱藻属 Leptocylindrus P.T.Cleve, 1889
- Tenuicylindrus D.Nanjappa & A.Zingone, 2013
